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企业公众号注册限制后的小程序注册数量会受到相应限制。具体来说，一个主体（企业）在注册企业公众号后，可以申请注册的小程序数量是有限制的。关于具体的数量限制，建议查询微信公众平台的官方政策或联系微信客服以获取最新和详细信息。

注册小程序还需要遵守微信的相关政策和规定，确保合法合规，如有任何疑问或需要进一步的帮助，建议咨询微信官方客服或专业人士。